Une déficience de la fumarylacétoacétate hydrolase, dernière enzyme du sentier catabolique de la tyrosine entraîne un désordre appelé tyrosinémie héréditaire de type I. Cette enzyme est exprimée principalement au niveau du foie et des reins. Cependant, l’analyse de la région promotrice de ce gène révèle la présence de 11 sites de liaison au facteur de transcription Sp1 et l’absence de boîte TATA et CAAT, caractéristiques associées aux gènes ubiquitaires. Pour résoudre ce dilemme, nous avons entrepris d’étudier la région promotrice du gène murin de la fah par identification des sites d’initiation de la transcription, par l’identification des sites de liaison possibles pour des facteurs de transcription et par transfection transitoire de cette région promotrice dans les cellules HeLa, NIH3T3 et HepG2. Nos résultats suggèrent que le promoteur agit de façon ubiquitaire et qu’il y a absence de promoteurs alternatifs pouvant expliquer la spécificité tissulaire de son expression.

La réalisation de ce projet de recherche m’a permis de découvrir le monde merveilleux de la recherche scientifique et de la biologie moléculaire et cellulaire.

Je tiens à remercier tout d’abord mon superviseur le Dr. Robert M. Tanguay pour m’avoir donné ma première chance dans le domaine de la science et de m’avoir donné le goût de persévérer dans ce domaine.

Je remercie également mes collègues de travail; Natacha Dreumont pour sa patience, ses encouragements et ses idées; Geneviève Morrow, Anne Bergeron, Jacques Poudrier et Sébastien Michaud pour leurs nombreuses suggestions et recommandations; Chantale Langlois, Sébastien Morin, Marie-Claire Goulet, Marie-Odile Guimond, Diana Orejuela, Marie-Claire Goulet et Mélanie Samson pour avoir créé une ambiance de travail agréable et pour toutes nos discussions.

Je tiens à remercier mon épouse Cynthia Horth pour avoir accepté de vivre séparé, elle à Montréal et moi à Québec, et de m’avoir supporté pendant ces deux années.

Je remercie mes parents Daniel Lachance et Cécile Boisclair de m’avoir encouragé, pour leur entrain et leur aide.

Je remercie mes beaux-parents pour nous avoir changé les idées et de nous avoir encouragé, moi et ma femme, durant ces deux années. Je remercie également mes amis pour toutes nos discussions à propos de la science et de nos projets d’avenir.

Finalement, je remercie l’organisme CRSNG pour son soutier financier durant ces deux années de maîtrise.

AARE Amino Acid Response Element , élément de réponse aux acides aminés

ADN Acide déoxyribonucléique

ADNc ADN complémentaire

ALA Acide δ-aminolévulinique

ALAD δ-Aminolévulinique déhydratase

AMPc Adénosine monophosphate cyclique

ARN Acide ribonucléique

ARNm ARN messanger

ARN pol II ARN polymérase II

ARNr ARN ribosomal

bZIP Basic Leucine Zipper , domaine basique à fermeture éclair à leucine

CAT Chloramphénicol acétyltransférase

C/EBP CCAAT/Enhancer Binding Protein , protéine liant les séquences stimulatrices de type CAAT

CIP Calf Intestinal Phosphatase , phosphatase intestinale de veau

CRE cAMP Response Element , élément de réponse à l’AMPc

DEPC Diéthylpyrocarbonate

DMEM Dulbecco’s Modified Eagle’s Medium , milieu de culture Eagle de type Dulbecco

DPE Downstream Promoter Element , élément promoteur en aval

ENU N-éthyl-N-nitrosourea

FAA Fumarylacétoacétate

FAH Fumarylacétoacétate hydrolase

FBS Fœtal Bovine Serum , sérum foetal de boeuf

β-GAL β-Galactosidase

Glu Glutamate

GLUT2 Transporteur de glucose de type 2

GRE Glucocorticoid Response Element , élément de réponse aux glucocorticoïdes

GSH Glutathion

GSTZ-1 Gutathion transférase zéta-1

HGO Homogentisate dioxygénase

His Histidine

HMPOBA 4-(Hydroxyméthylphosphinoyl)-3-oxo-butanoique

HNF Hepatocyte Nuclear Factor , facteur nucléaire des hépatocytes

H₂O Eau

HPPD 4-Hydroxyphénylpyruvate dioxygénase

HTI Hereditary Tyrosinemia Type I , tyrosinémie héréditaire de type I

HTII Hereditary Tyrosinemia type II , tyrosinémie héréditaire de type II

HTIII Hereditary Tyrosinemia type III , tyrosinémie héréditaire de type III

IGF-1 Insulin-like Growth Factor , facteur de croissance similaire à l’insuline

Inr Initiator , initiateur

IR Récepteur de l’insuline

IVS Intervening Sequence , séquence intervenante dans l’épissage

kb Kilobase

LB Milieu de culture bactérien Luria-Bertani

M Molaire

MAA Maléylacétoacétate

MAI Maléylacétoacétate isomérase

Mb Mégabase

ml Millilitre

mM Millimolaire

M-MLV Moloney Murine Leukemia Virus , virus de la leucémie de Moloney de la souris

nm Nanomètre

NTBC 2(Nitro-4-fluorométhylbenzoyl)-1,3-cyclohexanedione

OATP-C O rganic Anion Transporting Polypeptide , polypeptide transportant les anions organiques de type C

ORF Open Reading Frame , cadre de lecture ouvert

pb Paire de bases

PCR Polymerase Chain Reaction , réaction de polymérisation en chaîne

PEPCK Phosphoénolpyruvate carboxykinase

PEI Polyéthylénimine

PDX-1 Pancreas Duodenum Homeobox-1 , facteur de transcription de type homéobox-1 du pancréas et du duodénum)

PGC-1α Coactivateur 1α du récepteur γ du proliférateur activé du péroxisome (PPAR)

PLB Passive Lysis Buffer , tampon de lyse passif

POU Acronyme dérivé de Pit-1, Oct-1/2 et Unc-86

PPAR γ2 Peroxisome Proliferator-activated Receptor-γ , récepteur γ2 du proliférateur activé du péroxisome

RALDH1 Rétinal déhydrogénase de type 1 du rat

5’RLM-RACE 5’RNA Ligation-Mediated Rapid Amplification of cDNA Ends , amplification rapide des extremités 5’ des ADNc médiée par la ligation d’un adapteur d’ARN

RT-PCR Transcriptase inverse-PCR

SA Succinylacétone

SAA Succinylacétoacétate

SI Sucrase-isomaltase

SLSJ Saguenay-Lac-St-Jean

Sp1   Specific protein 1 , protéine spécifique 1

SPT Sérine:pyruvate aminotransférase

TAP Tobacco Acid Pyrophosphatase , pyrophosphatase acide de la plante du tabac

TAT Tyrosine aminotranférase

TBP TATA-Binding Protein , protéine liant la séquence d’ADN : TATA

TAF_II TBP-Associated Factors , facteurs associés à TBP

dTAF Drosophila TAF , TAF de drosophile

TFIID Transcription factor IID , facteur de transcription IID

SIT Site d’initiation de la transcription

5’UTR 5’UntranslatedRregion , région en 5’ transcrite mais non-traduite

X-GAL 5-Bromo-4-chloro-3indoyl-β-D-galactopyranoside

XKLF Krüppel-Like Factors , facteurs semblables au facteur de transcription Krüppel de la drosophile